Dynamic Systems Biology Modeling and Simulation

دسته بندی: زیست شناسی
ویرایش: 1 
نویسندگان: Joseph DiStefano III  
سری:  
ISBN (شابک) : 0124104118, 9780124104112 
ناشر: Academic Press 
سال نشر: 2013 
تعداد صفحات: 882 
زبان: English 
فرمت فایل : PDF (درصورت درخواست کاربر به PDF، EPUB یا AZW3 تبدیل می شود) 
حجم فایل: 56 مگابایت 

قیمت کتاب (تومان) : 35,000

مدل‌سازی و شبیه‌سازی زیست‌شناسی سیستم‌های پویاروش‌های چند مقیاسی کلاسیک و معاصر را برای مدل‌سازی ریاضی و شبیه‌سازی رایانه‌ای سیستم‌های زیستی پویا - از مولکولی/سلولی، سیستم ارگان‌ها، تا سطوح جمعیتی یکپارچه و متحد می‌کند. آموزش کتاب به عنوان یک آموزش منظم و مشروح شده - با نامگذاری واضح و یکپارچه - برگرفته از تلاش‌های مدل‌سازی، انتشارات و تدریس خود نویسنده در طول نیم قرن است. ابهامات در برخی مفاهیم و ابزارها روشن شده و برخی دیگر در دسترس تر و کاربردی تر می شوند. دومی شامل نظریه کیفی جدید و روش‌شناسی برای تشخیص امضاهای دینامیکی در داده‌ها با استفاده از مدل‌های ساختاری (چند بخشی و شبکه) و نظریه گراف است. و تحلیل مدل‌های ساختاری و اندازه‌گیری (داده‌ها) برای امکان‌سنجی کمی. این سطح از پایه تا متوسط ​​است، با تاکید زیادی بر مدل‌سازی زیستی از داده‌های زیستی واقعی، برای استفاده در کاربردهای واقعی.

• پوشش مقدماتی مفاهیم ریاضی هسته‌ای مانند معادلات دیفرانسیل و تفاوت خطی و غیرخطی، تبدیل‌های لاپلاس، خطی مباحث جبر، احتمال، آمار و تصادفی؛ PLUS ...
• زیست‌شناسی، بیوشیمی، بیوفیزیک یا فارماکولوژی مربوطه برای مدل‌سازی برای حمایت از درک ملغمه "مدل‌سازی ریاضی" با علوم زیستی ارائه شده است.
• تاکید فراوان بر روی کمی‌سازی و همچنین ساخت و تجزیه و تحلیل مدل‌های زیستی: شامل روش‌شناسی و ابزارهای محاسباتی برای شناسایی پارامترها و تجزیه و تحلیل حساسیت؛ تخمین پارامتر از داده‌های واقعی؛ تشخیص و ساده‌سازی مدل؛ و طراحی و بهینه‌سازی آزمایش زیستی عملی است.
• وب‌سایت Companion راه‌حل‌هایی ارائه می‌دهد. و کد برنامه برای مثال‌ها و تمرین‌ها با استفاده از Matlab، Simulink، VisSim، SimBiology، SAAMII، AMIGO، Copasi و مدل‌های کدگذاری‌شده با SBML.

Dynamic Systems Biology Modeling and Simuation consolidates and unifies classical and contemporary multiscale methodologies for mathematical modeling and computer simulation of dynamic biological systems - from molecular/cellular, organ-system, on up to population levels.  The book pedagogy is developed as a well-annotated, systematic tutorial - with clearly spelled-out and unified nomenclature - derived from the author's own modeling efforts, publications and teaching over half a century.  Ambiguities in some concepts and tools are clarified and others are rendered more accessible and practical.  The latter include novel qualitative theory and methodologies for recognizing dynamical signatures in data using structural (multicompartmental and network) models and graph theory; and analyzing structural and measurement (data) models for quantification feasibility.  The level is basic-to-intermediate, with much emphasis on biomodeling from real biodata, for use in real applications.

• Introductory coverage of core mathematical concepts such as linear and nonlinear differential and difference equations, Laplace transforms, linear algebra, probability, statistics and stochastics topics; PLUS ...
• The pertinent biology, biochemistry, biophysics or pharmacology for modeling are provided, to support understanding the amalgam of "math modeling” with life sciences.
• Strong emphasis on quantifying as well as building and analyzing biomodels: includes methodology and computational tools for parameter identifiability and sensitivity analysis; parameter estimation from real data; model distinguishability and simplification; and practical bioexperiment design and optimization.
• Companion website provides solutions and program code for examples and exercises using Matlab, Simulink, VisSim, SimBiology, SAAMII, AMIGO, Copasi and SBML-coded models.