مشخصات کتاب

DNA Microarrays, Part A: Array Platforms and Wet-Bench Protocols

ویرایش: 1 
نویسندگان: Alan Kimmel. and Brian Oliver (Eds.)  
سری: Methods in Enzymology 410 
ISBN (شابک) : 9780121828158 
ناشر: Academic Press 
سال نشر: 2006 
تعداد صفحات: 508 
زبان: English 
فرمت فایل : PDF (درصورت درخواست کاربر به PDF، EPUB یا AZW3 تبدیل می شود) 
حجم فایل: 9 مگابایت 

در صورت تبدیل فایل کتاب DNA Microarrays, Part A: Array Platforms and Wet-Bench Protocols به فرمت های PDF، EPUB، AZW3، MOBI و یا DJVU می توانید به پشتیبان اطلاع دهید تا فایل مورد نظر را تبدیل نمایند.

توجه داشته باشید کتاب DNA Microarrays ، قسمت A: سکوی Array و پروتکل های مرطوب کننده نسخه زبان اصلی می باشد و کتاب ترجمه شده به فارسی نمی باشد. وبسایت اینترنشنال لایبرری ارائه دهنده کتاب های زبان اصلی می باشد و هیچ گونه کتاب ترجمه شده یا نوشته شده به فارسی را ارائه نمی دهد.

توضیحاتی در مورد کتاب DNA Microarrays ، قسمت A: سکوی Array و پروتکل های مرطوب کننده

فناوری‌های ریزآرایه‌های DNA مدرن در 25 سال گذشته به حدی تکامل یافته‌اند که اکنون می‌توان میلیون‌ها اندازه‌گیری را از یک آزمایش انجام داد. این دو جلد، بخش‌های A و B در سری روش‌ها در آنزیم‌شناسی، روش‌هایی را ارائه می‌دهند که هر زیست‌شناس مولکولی را از طریق فرآیند برنامه‌ریزی، اجرا، و انتشار نتایج ریزآرایه‌ها به پیش می‌برد.

قسمت A با مروری بر تعدادی از پلتفرم‌های ریزآرایه، چه تجاری و چه به صورت آکادمیک تولید شده، شروع می‌شود و شامل پروتکل‌های نیمکت مرطوب برای انجام تجزیه و تحلیل بیان سنتی و تکنیک‌های مشتق شده مانند تشخیص اشغال فاکتور رونویسی و وضعیت کروماتین است. پروتکل‌های نیمکت مرطوب و تکنیک‌های عیب‌یابی در بخش B ادامه دارند. این تکنیک‌ها به خوبی ریشه در زیست‌شناسی مولکولی سنتی دارند و در حالی که به مراقبت سنتی نیاز دارند، محققی که می‌تواند به‌طور تکرارپذیر لکه‌های شمالی یا جنوبی زیبا تولید کند، نباید در ایجاد هیبریداسیون آرایه‌های زیبا مشکلی نداشته باشد.

مدیریت داده ها یک مشکل جدیدتر برای اکثر زیست شناسان است. بخش اعظم بخش B طیف وسیعی از تکنیک ها را برای مدیریت داده ها ارائه می دهد. این شامل مسائل مهم، از عادی سازی درون و بین آرایه ها، آپلود نتایج شما در مخازن عمومی برای داده های آرایه، و نحوه ادغام داده ها از منابع متعدد است. فصل‌هایی در بخش B هم برای اولین و هم برای متخصص بیوانفورماتیک وجود دارد.

· نمای کلی از پلتفرم ها ارائه می دهد
· شامل طراحی آزمایشی و پروتکل های نیمکت مرطوب
· ارائه روش های آماری و تجزیه و تحلیل داده ها، پایگاه داده های آرایه، تجسم داده ها و متا آنالیز

توضیحاتی درمورد کتاب به خارجی

Modern DNA microarray technologies have evolved over the past 25 years to the point where it is now possible to take many million measurements from a single experiment. These two volumes, Parts A & B in the Methods in Enzymology series provide methods that will shepard any molecular biologist through the process of planning, performing, and publishing microarray results.

Part A starts with an overview of a number of microarray platforms, both commercial and academically produced and includes wet bench protocols for performing traditional expression analysis and derivative techniques such as detection of transcription factor occupancy and chromatin status. Wet-bench protocols and troubleshooting techniques continue into Part B. These techniques are well rooted in traditional molecular biology and while they require traditional care, a researcher that can reproducibly generate beautiful Northern or Southern blots should have no difficulty generating beautiful array hybridizations.

Data management is a more recent problem for most biologists. The bulk of Part B provides a range of techniques for data handling. This includes critical issues, from normalization within and between arrays, to uploading your results to the public repositories for array data, and how to integrate data from multiple sources. There are chapters in Part B for both the debutant and the expert bioinformatician.

· Provides an overview of platforms
· Includes experimental design and wet bench protocols
· Presents statistical and data analysis methods, array databases, data visualization and meta analysis

فهرست مطالب

Content: 
[1] The Affymetrix GeneChipВ® Platform: An Overview Review Article
Pages 3-28
Dennise D. Dalma‐Weiszhausz, Janet Warrington, Eugene Y. Tanimoto, C. Garrett Miyada

[2] The Agilent In Situ‐Synthesized Microarray Platform Review Article
Pages 28-57
Paul K. Wolber, Patrick J. Collins, Anne B. Lucas, Anniek De Witte, Karen W. Shannon

[3] Illumina Universal Bead Arrays Review Article
Pages 57-73
Jian‐Bing Fan, Kevin L. Gunderson, Marina Bibikova, Joanne M. Yeakley, Jing Chen, Eliza Wickham Garcia, Lori L. Lebruska, Marc Laurent, Richard Shen, David Barker

[4] Microarray Oligonucleotide Probes Review Article
Pages 73-98
David P. Kreil, Roslin R. Russell, Steven Russell

[5] Automated Liquid Handling and High‐Throughput Preparation of Polymerase Chain Reaction‐Amplified DNA for Microarray Fabrication Review Article
Pages 99-120
Angela Burr, Kevin Bogart, Jason Conaty, Justen Andrews

[6] The Printing Process: Tips on Tips Review Article
Pages 121-135
Reed A. George

[7] Making and Using Spotted DNA Microarrays in an Academic Core Laboratory Review Article
Pages 135-168
Janet Hager

[8] Printing Your Own Inkjet Microarrays Review Article
Pages 168-189
Christopher G. Lausted, Charles B. Warren, Leroy E. Hood, Stephen R. Lasky

[9] Peptide Nucleic Acid Microarrays Made with (S,S)‐trans‐Cyclopentane‐Constrained Peptide Nucleic Acids Review Article
Pages 189-200
Mark A. Witschi, Jonathan K. Pokorski, Daniel H. Appella

[10] Optimizing Experiment and Analysis Parameters for Spotted Microarrays Review Article
Pages 203-221
Scott J. Neal, J. Timothy Westwood

[11] Sample Labeling: An Overview Review Article
Pages 222-237
Michael Brownstein

[12] Genomic DNA as a General Cohybridization Standard for Ratiometric Microarrays Review Article
Pages 237-279
Brian A. Williams, Richele M. Gwirtz, Barbara J. Wold

[13] Analysis of Sequence Specificities of DNA‐Binding Proteins with Protein Binding Microarrays Review Article
Pages 279-299
Martha L. Bulyk

[14] Microarray Analysis of RNA Processing and Modification Review Article
Pages 300-316
Timothy R. Hughes, Shawna L. Hiley, Arneet L. Saltzman, Tomas Babak, Benjamin J. Blencowe

Mapping the Distribution of Chromatin Proteins by ChIP on Chip Review Article
Pages 316-341
Nicolas NГЁgre, Sergey Lavrov, JГ©rГґme Hennetin, Michel Bellis, Giacomo Cavalli

[16] DamID: Mapping of In Vivo Protein–Genome Interactions Using Tethered DNA Adenine Methyltransferase Review Article
Pages 342-359
Frauke Greil, Celine Moorman, Bas van Steensel

Whole‐Genome Genotyping Review Article
Pages 359-376
Kevin L. Gunderson, Frank J. Steemers, Hongi Ren, Pauline Ng, Lixin Zhou, Chan Tsan, Weihua Chang, Dave Bullis, Joe Musmacker, Christine King, Lori L. Lebruska, David Barker, Arnold Oliphant, Kenneth M. Kuhn, Richard Shen

[18] Mapping Drosophila Genomic Aberration Breakpoints with Comparative Genome Hybridization on Microarrays Review Article
Pages 377-386
Jeremy N. Erickson, Eric P. Spana

[19] Performing Quantitative Reverse‐Transcribed Polymerase Chain Reaction Experiments Review Article
Pages 386-400
Georges Lutfalla, Gilles Uze

[20] The Application of Tissue Microarrays in the Validation of Microarray Results Review Article
Pages 400-415
Stephen M. Hewitt

[21] Mapping Histone Modifications by Nucleosome Immunoprecipitation Review Article
Pages 416-430
David J. Clark, Chang‐Hui Shen

Series Editors
Page II

Contributors to Volume 410
Pages IX-XI

Table of Contents
Pages V-VII

Author Index
Pages 431-460

Subject Index
Pages 461-469

Contents of Previous Volumes
Pages XIII-XXXVI

نظرات کاربران

کتاب های تصادفی

دانلود کتاب Sólo para mis ojos

دانلود کتاب The Mind Club: Who Thinks, What Feels, and Why It Matters

دانلود کتاب Bruce Springsteen. Tutte le canzoni

دانلود کتاب An Introduction to Said Nursi

دانلود کتاب Psicología de la invención en el campo matemático