Crop Systems Biology: Narrowing the gaps between crop modelling and genetics

توالی‌یابی ژنوم‌ها برای تعداد فزاینده‌ای از گونه‌های گیاهی تکمیل شده است، و محققان اکنون موفق به جداسازی و مشخص کردن بسیاری از QTL/ژن‌های مهم شده‌اند. با این حال، انتظارات بالا از ژنومیک به سمت تشخیص اینکه فیزیولوژی محصول نیز برای بهبود واقعی بهره‌وری محصول مهم است، در حال تغییر است. فرآیندها و شبکه های پیچیده در امتداد سطوح مختلف سلسله مراتبی رشد و توسعه محصول را می توان با کمک توصیف ریاضی آنها - مدل سازی به طور کامل درک کرد. کاربرد عملی بیشتر این فهم ها نیز نیازمند پیش بینی های کمی است. به منظور حمایت بهتر از طراحی، مهندسی و اصلاح برای محصولات و ارقام جدید برای بهبود تولیدات کشاورزی در شرایط گرمایش جهانی و تغییرات آب و هوایی، درخواست فزاینده ای برای یک رویکرد تحقیقاتی بین رشته ای وجود دارد که ترکیبی از ژنتیک و ژنومیک مدرن، فیزیولوژی سنتی و بیوشیمی، و بیوانفورماتیک و مدل سازی پیشرفته چنین رویکرد میان رشته ای سال هاست که در گروه های مختلف تحقیقاتی اعمال می شود. با این حال، به نظر می رسد در قالب انتشارات کتاب به طور کامل پوشش داده نشده است. ما می خواهیم یک پروژه کتاب در زمینه زیست شناسی سیستم های گیاهی - کاهش شکاف بین ژنوتیپ ها و فنوتیپ ها و شکاف های بین مدل سازی محصول و ژنتیک / ژنومیک را برای انتشار در سال 2013/2014 آغاز کنیم. این کتاب برای آن دسته از دانشمندان و دانشجویان فارغ التحصیل رشته زیست شناسی گیاهی بنیادی و علوم کشاورزی کاربردی که علاقه مند به پر کردن شکاف بین این دو رشته هستند، در نظر گرفته شده است. ما از گروهی از دانشمندان (که سوابق بسیار خوبی در انتشار مقالات عالی در این زمینه یا در زمینه‌های مرتبط نزدیک دارند) دعوت کرده‌ایم تا فصل‌هایی را در این کتاب جدید به اشتراک بگذارند، و آنها با این کار موافقت کردند.​

The sequencing of genomes has been completed for an increasing number of crop species, and researchers have now succeeded in isolating and characterising many important QTLs/genes. High expectations from genomics, however, are waving back toward the recognition that crop physiology is also important for realistic improvement of crop productivity. Complex processes and networks along various hierarchical levels of crop growth and development can be thoroughly understood with the help of their mathematical description – modelling. The further practical application of these understandings also requires quantitative predictions. In order to better support design, engineering and breeding for new crops and cultivars for improving agricultural production under global warming and climate change, there is an increasing call for an interdisciplinary research approach, which combines modern genetics and genomics, traditional physiology and biochemistry, and advanced bioinformatics and modelling. Such an interdisciplinary approach has been practised in various research groups for many years. However, it does not seem to be fully covered in the format of book publications. We want to initiate a book project on crop systems biology - narrowing the gaps between genotypes and phenotypes and the gaps between crop modelling and genetics/genomics, for publication in 2013/2014. The book will be meant for those scientists and graduate students from fundamental plant biology and applied crop science who are interested in bridging the gap between these two fields. We have invited a group of scientists (who have very good track records in publishing excellent papers in this field or in a closely related area) to contribute chapters to this new book, and they have agreed to do so.​