Computational and visualization techniques for structural bioinformatics using chimera

ویرایش:  
نویسندگان: Forbes J Burkowski  
سری: Chapman & Hall/CRC mathematical and computational biology series (Unnumbered) 
ISBN (شابک) : 9781439836613, 1439836612 
ناشر: CRC Press Taylor & Francis Group 
سال نشر: 2013 
تعداد صفحات: 455 
زبان: English 
فرمت فایل : PDF (درصورت درخواست کاربر به PDF، EPUB یا AZW3 تبدیل می شود) 
حجم فایل: 17 مگابایت 

قیمت کتاب (تومان) : 28,000

"این کتاب بر برنامه های کامپیوتری که داده های ساختاری پروتئین را با فایل های داده تولید کننده خروجی برنامه و بازخورد بصری در قالب یک نمایشگر مولکولی تجزیه و تحلیل می کند. بخش نظری متن هم مدل های ریاضی مربوط به ساختار مولکولی و هم استراتژی های محاسباتی موثر را در نظر می گیرد. با این مدل‌ها برای استخراج نتایج.بخش عملی متن UCSF Chimera را به‌عنوان یک \"workbench\" ارائه می‌کند که یک محیط برنامه‌نویسی پایتون و توانایی دیدن را فراهم می‌کند. خروجی برنامه در صفحه نمایش مولکولی. CD-ROM همراه شامل کد پایتون، شکل های رنگی و فایل های جلسه برای Chimera\"--

\"هدف این کتاب هنگام شرکت در کارگاه یا کنفرانسی در مورد بیوانفورماتیک ساختاری ممکن است نکات مهم را بشنوید از مکالماتی که با عباراتی مانند "تنظیم فسفوفروکتوکیناز"، "تجزیه مقدار منفرد"، یا "نمونه کلاسی" آمیخته شده است. استفاده از این اصطلاحات علم شناسی که به ترتیب از بیوشیمی، ریاضیات و علوم کامپیوتر ناشی می شود در این زمینه تعجب آور نخواهد بود زیرا این سه حوزه تحقیقاتی هسته تخصصی مورد نیاز برای مطالعه بیوانفورماتیک ساختاری شده اند:\"-- �بیشتر بخوانید...

"This book emphasizes computer programs that analyze protein structural data with program output generating data files and visual feedback in the form of a molecular display. The theoretical part of the text considers both the mathematical models related to molecular structure and the computational strategies that work with these models to derive results. The practical part of the text presents UCSF Chimera as a "workbench" that provides a Python programming environment and the ability to see program output in the molecular display. The accompanying CD-ROM includes Python code, color figures, and session files for Chimera"--

"Goals of this book while attending a workshop or conference on Structural Bioinformatics you may overhear tidbits of conversations that are interspersed with phrases such as "phosphofructokinase regulation", "singular value decomposition", or "class instantiation". The usage of such terminology, arising from biochemistry, mathematics, and computer science respectively would not be surprising in this setting because these three areas of investigation have become the core of expertise required for the study of structural bioinformatics:"-- �Read more...

Introduction: Macromolecules and Chimera. Accessing and Displaying Molecular Data with Chimera. Algorithms Dealing with Distance. Algorithms Dealing with Angles. Structure Overlap and Alignment. Potential Energy Functions. Rotamers and Side-Chain Conformation. Residue Networks. Appendices. Index.