Comparative Genomics

Comparative Genomics، جلد 1، مجموعه ای از پروتکل های قوی را برای زیست شناسان مولکولی ارائه می دهد که شروع به استفاده از ابزارهای تجزیه و تحلیل ژنومی مقایسه ای در زمینه های مختلف کرده اند. جلد اول شامل چهار بخش اول از هفت بخش است. در بخش اول، خواننده از طریق تعدادی ابزار تجسم با ژنوم‌ها آشنا می‌شود که به فرد اجازه می‌دهد در یک ژنوم خاص مورد علاقه جستجو کند. بخش دوم و سوم به تجزیه و تحلیل مقایسه ای در سطح توالی های منفرد می پردازد و روش های مفید در هم ترازی توالی، کشف موتیف های توالی حفظ شده و تحلیل استفاده از کدون را ارائه می دهد. بخش چهارم به شناسایی و خصوصیات ساختاری ژن‌های RNA غیر کدکننده می‌پردازد - پیش‌بینی این دسته از ژن‌ها به‌ویژه دشوار است و کشف این عناصر تقریباً به طور کامل به ژنومیک مقایسه‌ای وابسته است. با توجه به افزایش فوق العاده داده های زیست توالی موجود در ده سال گذشته، ژنومیکس مقایسه ای، جلد 1، به موقع، جامع و جدید است. جلد 2 همراه نیز از Humana Press موجود است.

Comparative Genomics, Volume 1, provides a collection of robust protocols for molecular biologists beginning to use comparative genomic analysis tools in a variety of areas. Volume I contains the first four of seven sections. In the first section, the reader is introduced to genomes via a number of visualization tools that allow one to browse through a particular genome of interest. The second and third sections deal with comparative analysis at the level of individual sequences, and present methods useful in sequence alignment, the discovery of conserved sequence motifs, and the analysis of codon usage. The fourth section deals with the identification and structural characterization of non-coding RNA genes — this class of genes is particularly difficult to predict, and discovery of these elements is almost completely reliant on comparative genomics. Given the tremendous increase in available biosequence data over the past ten years, Comparative Genomics, Volume 1, is timely, comprehensive, and novel. A companion Volume 2 is also available from Humana Press.