Comparative Genomics

Comparative Genomics، جلد 2، مجموعه ای از پروتکل های قوی را برای زیست شناسان مولکولی ارائه می دهد که شروع به استفاده از ابزارهای تجزیه و تحلیل ژنومی مقایسه ای در زمینه های مختلف کرده اند. جلد 2 شامل سه بخش از هفت بخش آخر است. در جلد دوم، بخش پنجم تعدادی ابزار برای تجزیه و تحلیل مقایسه ای خانواده های دامنه و ژن توضیح می دهد. این ابزارها به ویژه برای پیش‌بینی عملکرد پروتئین و همچنین برهمکنش‌های بالقوه پروتئین-پروتئین مفید هستند. در بخش ششم، روش‌های مقایسه گروه‌های ژن‌ها و ترتیب ژن‌ها و چندین ابزار برای تجزیه و تحلیل تکامل ژنوم مورد بحث قرار می‌گیرد. در نهایت، بخش هفتم به ژنومیک تطبیقی ​​تجربی می پردازد. این بخش شامل روش‌هایی برای مقایسه تعداد کپی ژن در کل ژنوم، هیبریداسیون مقایسه‌ای ژنومی، تجزیه و تحلیل SNP، و همچنین سیستم‌های نقشه‌برداری و تایپ ژنوم برای ژنوم‌های باکتریایی است. با توجه به افزایش فوق العاده داده های زیست توالی موجود در ده سال گذشته، ژنومیکس مقایسه ای، جلد 1، به موقع، جامع و جدید است. جلد 1 همراه نیز از Humana Press موجود است.

Comparative Genomics, Volume 2, provides a collection of robust protocols for molecular biologists beginning to use comparative genomic analysis tools in a variety of areas. Volume 2 contains the last three of seven sections. In the second volume, the fifth section describes a number of tools for comparative analysis of domain and gene families. These tools are particularly useful for predicting protein function as well as potential protein-protein interactions. In the sixth section, methods for comparing groups of genes and gene order are discussed, as are several tools for analyzing genome evolution. Finally, the seventh section deals with experimental comparative genomics. This section includes methods for comparing gene copy number across an entire genome, comparative genomic hybridization, SNP analysis, as well as genome-wide mapping and typing systems for bacterial genomes. Given the tremendous increase in available biosequence data over the past ten years, Comparative Genomics, Volume 1, is timely, comprehensive, and novel. A companion Volume 1 is also available from Humana Press.