Comparative and Evolutionary Genomics of Angiosperm Trees

با مشخص کردن تغییر در تمرکز ژنومیک درختان از تک گونه به رویکردهای مقایسه‌ای، این کتاب جنبه‌های بیولوژیکی، ژنومی و تکاملی درختان آنژیوسپرم را پوشش می‌دهد که اطلاعات و دیدگاه‌هایی را برای حمایت از محققان برای گسترش تمرکز تحقیقات خود ارائه می‌دهد. تنوع درختان آنژیوسپرم در مورفولوژی، آناتومی، فیزیولوژی و بیوشیمی توسط رشته‌های علمی مختلف توصیف و فهرست‌بندی شده است، اما مکانیسم‌های مولکولی، ژنتیکی و تکاملی زیربنای این تنوع اخیراً مورد بررسی قرار گرفته‌اند. به طور هیجان انگیزی، پیشرفت در فناوری های ژنومی و توالی یابی، عصر جدیدی از تحقیقات را آغاز می کند که به طور گسترده ژنومیک مقایسه ای نامیده می شود، که به طور همزمان از منشاء تکاملی و تنظیم ژنتیکی صفات مورد علاقه بهره برداری و توصیف می کند. در ژنومیک درختی، این تحقیق در حال انجام است، زیرا تعداد توالی های ژنوم کامل موجود برای درختان آنژیوسپرم با سرعتی چشمگیر در حال افزایش است و تعداد گونه هایی که داده های RNAseq برای آنها در دسترس است به سرعت در حال گسترش است. از آنجا که آنها به طور گسترده توسط ادبیات دیگر پوشش داده شده اند و به سرعت در حال تغییر هستند، رویکردهای فنی و محاسباتی - مانند آخرین فناوری های توالی یابی - تمرکز اصلی این کتاب نیست. در عوض، این جلد جامع دیدگاه ارزشمند و گسترده‌تری از ژنومیک درخت ارائه می‌کند که ارتباط آن بیشتر از جزئیات رویکردهای فنی امروزی است.

در بخش اول کتاب، پیشینه‌ای در مورد تکامل و تنوع درختان آنژیوسپرم بحث می‌شود. ، و همچنین توضیحاتی در مورد ویژگی های برجسته و تنوع فیزیولوژی منحصر به فرد و آناتومی چوب درختان آنژیوسپرم ارائه می دهد. بخش دوم دو گونه پیشرفته‌ترین مدل درخت آنژیوسپرم (صنوبر و اکالیپت) و همچنین گونه‌هایی را که به‌زودی به‌عنوان مدل‌های جدید ظاهر می‌شوند، بررسی می‌کند. بخش سوم ویژگی‌های ساختاری و تاریخچه‌های تکاملی ژنوم درختان آنژیوسپرم را تشریح می‌کند و به دنبال آن بخش چهارم با تمرکز بر ژنومیک صفات بیولوژیکی، اکولوژیکی و اقتصادی مورد توجه قرار می‌گیرد. به طور خلاصه، این کتاب یک منبع بنیادی به موقع و به خوبی ارجاع شده برای جامعه درختان جنگلی است که به دنبال رویکردهای مقایسه ای برای مطالعه درختان آنژیوسپرم هستند.

Marking the change in focus of tree genomics from single species to comparative approaches, this book covers biological, genomic, and evolutionary aspects of angiosperm trees that provide information and perspectives to support researchers broadening the focus of their research. The diversity of angiosperm trees in morphology, anatomy, physiology and biochemistry has been described and cataloged by various scientific disciplines, but the molecular, genetic, and evolutionary mechanisms underlying this diversity have only recently been explored. Excitingly, advances in genomic and sequencing technologies are ushering a new era of research broadly termed comparative genomics, which simultaneously exploits and describes the evolutionary origins and genetic regulation of traits of interest. Within tree genomics, this research is already underway, as the number of complete genome sequences available for angiosperm trees is increasing at an impressive pace and the number of species for which RNAseq data are available is rapidly expanding. Because they are extensively covered by other literature and are rapidly changing, technical and computational approaches—such as the latest sequencing technologies—are not a main focus of this book. Instead, this comprehensive volume provides a valuable, broader view of tree genomics whose relevance will outlive the particulars of current-day technical approaches.

The first section of the book discusses background on the evolution and diversification of angiosperm trees, as well as offers description of the salient features and diversity of the unique physiology and wood anatomy of angiosperm trees. The second section explores the two most advanced model angiosperm tree species (poplars and eucalypts) as well as species that are soon to emerge as new models. The third section describes the structural features and evolutionary histories of angiosperm tree genomes, followed by a fourth section focusing on the genomics of traits of biological, ecological, and economic interest. In summary, this book is a timely and well-referenced foundational resource for the forest tree community looking to embrace comparative approaches for the study of angiosperm trees.