Collaborative genomics projects : a comprehensive guide

پروژه های مشترک ژنومیک: راهنمای جامع شامل رویه های عملیاتی، ملاحظات خط مشی و درس های بسیاری است که توسط پروژه اطلس ژنوم سرطان آموخته شده است. این کتاب خواننده را از طریق روش‌هایی در جمع‌آوری نمونه بیمار، ایجاد خطوط لوله تولید و تجزیه و تحلیل داده، ذخیره و انتشار داده‌ها، کنترل کیفیت، ممیزی و گزارش‌دهی راهنمایی می‌کند.

این کتاب برای کسانی که به دنبال تنظیم هستند ضروری است. ایجاد یا همکاری در یک پروژه تحقیقاتی ژنومیک در مقیاس بزرگ. همه نویسندگان در برنامه اطلس ژنوم سرطان (TCGA) مشارکت دارند، تلاشی با بودجه NIH برای ایجاد کاتالوگ جامعی از تغییرات ژنومی در بیش از 35 نوع سرطان.

از آنجایی که هزینه تعیین توالی ژنومی در حال کاهش است، محققان بیشتر و بیشتری از داده های ژنومی برای اطلاع از بیولوژی بیماری استفاده می کنند. مقدار داده های ژنومی تولید شده به طور تصاعدی در حال رشد است و باید پروتکل هایی برای ذخیره سازی طولانی مدت، انتشار و تنظیم این داده ها برای تحقیق ایجاد شود. نویسندگان کتاب یک کتاب راهنمای کامل در مورد مدیریت پروژه های تحقیقاتی شامل داده های ژنومی که از طریق تکامل برنامه TCGA آموخته شده است، ایجاد کرده اند، پروژه ای که اساساً در ایالات متحده انجام شده است، اما تأثیر و درس های آموخته شده آن می تواند برای مخاطبان بین المللی اعمال شود.

• چارچوبی را برای مدیریت پروژه های تحقیقاتی ژنومیک در مقیاس بزرگ با مشارکت چند همکار ایجاد می کند
• درس های آموخته شده از طریق TCGA را برای آماده شدن برای موانع احتمالی تشریح می کند
• خط مشی را ارزیابی می کند. ملاحظاتی که برای جلوگیری از مشکلات لازم است
• راهبردهایی را برای کارآمدتر کردن مدیریت پروژه توصیه می‌کند

Collaborative Genomics Projects: A Comprehensive Guide contains operational procedures, policy considerations, and the many lessons learned by The Cancer Genome Atlas Project. This book guides the reader through methods in patient sample acquisition, the establishment of data generation and analysis pipelines, data storage and dissemination, quality control, auditing, and reporting.

This book is essential for those looking to set up or collaborate within a large-scale genomics research project. All authors are contributors to The Cancer Genome Atlas (TCGA) Program, a NIH- funded effort to generate a comprehensive catalog of genomic alterations in more than 35 cancer types.

As the cost of genomic sequencing is decreasing, more and more researchers are leveraging genomic data to inform the biology of disease. The amount of genomic data generated is growing exponentially, and protocols need to be established for the long-term storage, dissemination, and regulation of this data for research. The book's authors create a complete handbook on the management of research projects involving genomic data as learned through the evolution of the TCGA program, a project that was primarily carried out in the US, but whose impact and lessons learned can be applied to international audiences.

• Establishes a framework for managing large-scale genomic research projects involving multiple collaborators
• Describes lessons learned through TCGA to prepare for potential roadblocks
• Evaluates policy considerations that are needed to avoid pitfalls
• Recommends strategies to make project management more efficient