Celiac Disease: Methods and Protocols

این جلد تجزیه و تحلیل مولکولی مفصلی از مسیرهای مرتبط و انواع سلول های دخیل در بیماری سلیاک ارائه می دهد و فناوری های جدیدی مانند توالی یابی نسل بعدی را در بر می گیرد. این کتاب به سه بخش تقسیم می‌شود: بخش اول مروری بر پس‌زمینه با تعدادی مرور برای توصیف تاریخچه و ماهیت بیماری، تشخیص آن، نقش مدل‌های حیوانی و طرح‌های مطالعاتی برای بررسی حساسیت ژنتیکی ارائه می‌دهد. بخش دوم تکنیک‌های مولکولی، از جمله کشت بافت، جداسازی و شبیه‌سازی انواع سلول‌های مرتبط، تجزیه و تحلیل محتوای بالای بیوپسی‌ها، و ژنوتیپ HLA را شرح می‌دهد. بخش پایانی کتاب با طرح کلی برنامه‌نویسی برای مدیریت داده‌ها آغاز می‌شود، با تمرکز بر ابزارهایی که آزادانه در دسترس محققانی هستند که می‌خواهند آنها را کشف کنند. همچنین خطوط لوله تجزیه و تحلیل را برای پیش‌بینی بیوانفورماتیک آنتی‌ژنیسیته، کنترل کیفی و تجزیه و تحلیل داده‌های GWAS و تجزیه و تحلیل رونوشت با توالی‌یابی نسل بعدی توصیف می‌کند. این فصل‌ها که با فرمت بسیار موفق مجموعه روش‌ها در زیست‌شناسی مولکولی نوشته شده‌اند، شامل مقدمه‌ای بر موضوعات مربوطه، فهرستی از مواد و معرف‌های لازم، پروتکل‌های آزمایشگاهی گام به گام، قابل تکرار آسان و نکاتی در مورد عیب‌یابی است. و اجتناب از تله‌های شناخته شده.

معتبر و کامل، بیماری سلیاک: روش‌ها و پروتکل‌هاروش‌های جدید و سنتی‌تری را در زیست‌شناسی مولکولی و ایمونولوژی به منظور ارائه یک بسته ابزار گرد هم می‌آورد. برای تمام مراحل تحقیق در مورد بیماری سلیاک - از جنبه های عملی شناسایی، به دست آوردن، تثبیت و نگهداری نمونه های با کیفیت بالا، تا تجزیه و تحلیل مولکولی و بیوانفورماتیک.

This volume provides detailed molecular analysis of the associated pathways and cell types involved in Celiac Disease, and embraces new technologies such as next generation sequencing. The book is divided into three parts: Part I gives a background overview with a number of reviews to describe the history and nature of the disease, its diagnosis, the role of animal models, and study designs for investigating genetic susceptibility. Part II describes molecular techniques, including tissue culture, isolation and cloning of relevant cell types, high content analysis of biopsies, and HLA genotyping. The final part of the book begins with an outline of scripting for data management, focusing on tools that are freely available to researchers who wish to explore them. It also describes analysis pipelines for bioinformatics prediction of antigenicity, quality control and analysis of GWAS data, and transcriptome analysis by next generation sequencing. Written in the highly successful Methods in Molecular Biology series format, chapters include introductions to their respective topics, lists of the necessary materials and reagents, step-by-step, readily reproducible laboratory protocols, and tips on troubleshooting and avoiding known pitfalls.

Authoritative and thorough, Celiac Disease: Methods and Protocols brings together novel and more traditional methods in molecular biology and immunology, in order to provide a tool-kit for all stages for Celiac Disease research—from the practicalities of identifying, obtaining, stabilizing and maintaining high quality samples, to molecular analysis and bioinformatics.