Biological Membranes: A Molecular Perspective from Computation and Experiment

رابط بین یک سلول زنده و دنیای اطراف نقش مهمی در بسیاری از فرآیندهای بیولوژیکی پیچیده ایفا می کند. همجوشی اسپرم/تخمک، همجوشی ویروس/سلول، اگزوسیتوز، اندوسیتوز و نفوذ یون چند نمونه از فرآیندهای مربوط به غشا هستند. در سال‌های اخیر، ابزارهای قدرتمندی مانند لووگرافی کریستالی اشعه ایکس، میکروسکوپ الکترونی، رزونانس مغناطیسی هسته‌ای، و طیف‌سنجی فروسرخ و رامان برای توصیف ساختار و دینامیک غشاهای زیستی توسعه یافته‌اند. با وجود این پیشرفت، بسیاری از عوامل مسئول عملکرد غشاهای زیستی هنوز به خوبی شناخته نشده اند. غشاء یک ساختار مایع کریستالی فوق مولکولی بسیار پیچیده است که عمدتاً از لیپیدها تشکیل شده است و یک لایه دوگانه را تشکیل می دهد که پروتئین ها و سایر مولکول های زیستی به آن متصل می شوند. اغلب، محیط دولایه لیپیدی به عنوان یک دال بدون ساختار هیدروفوبیک ارائه می شود که یک نیروی محرکه ترمودینامیکی برای تقسیم اسیدهای آمینه یک پروتئین غشایی بر اساس حلالیت آنها ارائه می کند. با این حال، بسیاری از پیچیدگی های مولکولی محیط دو لایه فسفولیپید در چنین نمای ساده نادیده گرفته می شود. این احتمال وجود دارد که جزئیات اتمی ناحیه گروه سر قطبی و انتقال از آب حجیم به هسته آبگریز غشاء مهم باشد. بنابراین، درک عوامل مسئول عملکرد غشاهای زیستی نیازمند توصیف بهتر در سطح مولکولی از نحوه تعامل پروتئین‌ها با مولکول‌های لیپید، نحوه تأثیر لیپیدها بر ساختار پروتئین و نحوه تنظیم مولکول‌های لیپید عملکرد پروتئین است.

The interface between a living cell and the surrounding world plays a critical role in numerous complex biological processes. Sperm/egg fusion, virus/cell fusion, exocytosis, endocytosis, and ion permeation are a few examples of processes involving membranes. In recent years, powerful tools such as X-ray crystal­ lography, electron microscopy, nuclear magnetic resonance, and infra-red and Raman spectroscopy have been developed to characterize the structure and dy­ namics of biomembranes. Despite this progress, many of the factors responsible for the function of biomembranes are still not well understood. The membrane is a very complicated supramolecular liquid-crystalline structure that is largely composed of lipids, forming a bilayer, to which proteins and other biomolecules are anchored. Often, the lipid bilayer environment is pictured as a hydropho­ bic structureless slab providing a thermodynamic driving force to partition the amino acids of a membrane protein according to their solubility. However, much of the molecular complexity of the phospholipid bilayer environment is ignored in such a simplified view. It is likely that the atomic details of the polar head­ group region and the transition from the bulk water to the hydrophobic core of the membrane are important. An understanding of the factors responsible for the function of biomembranes thus requires a better characterization at the molec­ ular level of how proteins interact with lipid molecules, of how lipids affect protein structure and of how lipid molecules might regulate protein function.