مشخصات کتاب

Bioinformatics with Python Cookbook: Learn how to use modern Python bioinformatics libraries and applications to do cutting-edge research in computational biology

دسته بندی: مولکولی: بیوانفورماتیک
ویرایش: 2 
نویسندگان: Tiago Antao  
سری:  
ISBN (شابک) : 1789344697, 9781789344691 
ناشر: Packt Publishing 
سال نشر: 2018 
تعداد صفحات: 352 
زبان: English 
فرمت فایل : PDF (درصورت درخواست کاربر به PDF، EPUB یا AZW3 تبدیل می شود) 
حجم فایل: 22 مگابایت 

کلمات کلیدی مربوط به کتاب کتاب آشپزی بیوانفورماتیک با پایتون: یاد بگیرید چگونه از کتابخانه ها و برنامه های کاربردی بیوانفورماتیک مدرن پایتون برای انجام تحقیقات پیشرفته در زیست شناسی محاسباتی استفاده کنید.: پایتون، بیوانفورماتیک، تجزیه و تحلیل اجزای اصلی، اسپارک آپاچی، خطوط لوله، داکر، R، پارکت آپاچی، ژوپیتر، شبیه‌سازی، HDF5، آناکوندا، آنالیز فیلوژنتیک، ژنتیک جمعیت، بیوپیتون، داده‌های توالی نسل بعدی، پروتئومیکس، ژنتوم، GenBank، Ensembl، HTSeq، PLINK، Genepop، PyMOL، Galaxy، Apache Dask

در صورت تبدیل فایل کتاب Bioinformatics with Python Cookbook: Learn how to use modern Python bioinformatics libraries and applications to do cutting-edge research in computational biology به فرمت های PDF، EPUB، AZW3، MOBI و یا DJVU می توانید به پشتیبان اطلاع دهید تا فایل مورد نظر را تبدیل نمایند.

توجه داشته باشید کتاب کتاب آشپزی بیوانفورماتیک با پایتون: یاد بگیرید چگونه از کتابخانه ها و برنامه های کاربردی بیوانفورماتیک مدرن پایتون برای انجام تحقیقات پیشرفته در زیست شناسی محاسباتی استفاده کنید. نسخه زبان اصلی می باشد و کتاب ترجمه شده به فارسی نمی باشد. وبسایت اینترنشنال لایبرری ارائه دهنده کتاب های زبان اصلی می باشد و هیچ گونه کتاب ترجمه شده یا نوشته شده به فارسی را ارائه نمی دهد.

توضیحاتی در مورد کتاب کتاب آشپزی بیوانفورماتیک با پایتون: یاد بگیرید چگونه از کتابخانه ها و برنامه های کاربردی بیوانفورماتیک مدرن پایتون برای انجام تحقیقات پیشرفته در زیست شناسی محاسباتی استفاده کنید.

برای تجزیه و تحلیل مقادیر زیادی از داده های بیولوژیکی، کتابخانه های توالی یابی مدرن و نسل بعدی را از اکوسیستم پایتون کشف کنید. ویژگی های کلیدی • تجزیه و تحلیل پیچیده بیوانفورماتیک را با استفاده از مهمترین کتابخانه ها و برنامه های کاربردی پایتون انجام دهید • توالی یابی نسل بعدی، متاژنومیکس، تجزیه و تحلیل خودکار، ژنتیک جمعیت و موارد دیگر را اجرا کنید • تکنیک های مختلف آماری و یادگیری ماشینی برای تجزیه و تحلیل داده های بیوانفورماتیک را بررسی کنید توضیحات کتاب بیوانفورماتیک یک زمینه تحقیقاتی فعال است که از طیف وسیعی از محاسبات ساده تا پیشرفته برای استخراج اطلاعات ارزشمند از داده های بیولوژیکی استفاده می کند. این کتاب توالی یابی نسل بعدی، ژنومیک، متاژنومیکس، ژنتیک جمعیت، فیلوژنتیک و پروتئومیکس را پوشش می دهد. شما تکنیک های برنامه نویسی مدرن را برای تجزیه و تحلیل مقادیر زیادی از داده های بیولوژیکی یاد خواهید گرفت. با کمک مثال‌های واقعی، مجموعه داده‌ها را با استفاده از ابزارها و کتابخانه‌های مختلف پایتون تبدیل، تجزیه و تحلیل و تجسم خواهید کرد. این کتاب به شما کمک می‌کند تا درک بهتری از کار با سرور Galaxy داشته باشید، که پرکاربردترین سیستم خط لوله مبتنی بر وب بیوانفورماتیک است. این نسخه به روز شده همچنین شامل تکنیک های پیشرفته فیلترینگ توالی نسل بعدی است. همچنین موضوعاتی مانند کشف SNP را با استفاده از رویکردهای آماری تحت چارچوب‌های محاسباتی با عملکرد بالا مانند Dask و Spark بررسی خواهید کرد. در پایان این کتاب، شما می توانید از تکنیک ها و چارچوب های برنامه نویسی مدرن برای مقابله با سیل روزافزون داده های بیوانفورماتیک استفاده و پیاده سازی کنید. آنچه خواهید آموخت • نحوه پردازش مجموعه داده های بزرگ توالی یابی نسل بعدی (NGS) را بیاموزید • با استفاده از فرمت های FASTQ، BAM، و VCF با مجموعه داده ژنومی کار کنید • انجام مقایسه توالی و بازسازی فیلوژنتیک را بیاموزید • انجام تجزیه و تحلیل پیچیده با داده های پروتئومیکس • از پایتون برای تعامل با سرورهای گلکسی استفاده کنید • از تکنیک های محاسباتی با کارایی بالا با Dask و Spark استفاده کنید • با استفاده از Cytoscape تعاملات داده های پروتئینی را تجسم کنید • از PCA و Decision Trees، دو تکنیک یادگیری ماشین، با مجموعه داده های بیولوژیکی استفاده کنید این کتاب برای چه کسی است این کتاب برای دانشمندان داده، تحلیلگران بیوانفورماتیک، محققان و توسعه دهندگان پایتون است که می خواهند با استفاده از یک رویکرد مبتنی بر دستور العمل به مشکلات بیولوژیکی و بیوانفورماتیکی متوسط ​​تا پیشرفته بپردازند. دانش کاری زبان برنامه نویسی پایتون انتظار می رود.

توضیحاتی درمورد کتاب به خارجی

Discover modern, next-generation sequencing libraries from Python ecosystem to analyze large amounts of biological data Key Features • Perform complex bioinformatics analysis using the most important Python libraries and applications • Implement next-generation sequencing, metagenomics, automating analysis, population genetics, and more • Explore various statistical and machine learning techniques for bioinformatics data analysis Book Description Bioinformatics is an active research field that uses a range of simple-to-advanced computations to extract valuable information from biological data. This book covers next-generation sequencing, genomics, metagenomics, population genetics, phylogenetics, and proteomics. You'll learn modern programming techniques to analyze large amounts of biological data. With the help of real-world examples, you'll convert, analyze, and visualize datasets using various Python tools and libraries. This book will help you get a better understanding of working with a Galaxy server, which is the most widely used bioinformatics web-based pipeline system. This updated edition also includes advanced next-generation sequencing filtering techniques. You'll also explore topics such as SNP discovery using statistical approaches under high-performance computing frameworks such as Dask and Spark. By the end of this book, you'll be able to use and implement modern programming techniques and frameworks to deal with the ever-increasing deluge of bioinformatics data. What you will learn • Learn how to process large next-generation sequencing (NGS) datasets • Work with genomic dataset using the FASTQ, BAM, and VCF formats • Learn to perform sequence comparison and phylogenetic reconstruction • Perform complex analysis with proteomics data • Use Python to interact with Galaxy servers • Use high-performance computing techniques with Dask and Spark • Visualize protein dataset interactions using Cytoscape • Use PCA and Decision Trees, two machine learning techniques, with biological datasets Who this book is for This book is for data scientists, bioinformatics analysts, researchers, and Python developers who want to address intermediate-to-advanced biological and bioinformatics problems using a recipe-based approach. Working knowledge of the Python programming language is expected.

فهرست مطالب

1. Python and the Surrounding Software Ecology
2. Next-generation Sequencing
3. Working with Genomes
4. Population Genetics
5. Population Genetics Simulation
6. Phylogenetics
7. Using the Protein Data Bank
8. Bioinformatics pipelines
9. Python for Big Genomics Datasets
10. Other Topics in Bioinformatics
11. Machine learning in Bioinformatics

نظرات کاربران

کتاب های مرتبط

دانلود کتاب Omic Association Studies with R and Bioconductor

دانلود کتاب Knowledge-Based Bioinformatics: From analysis to interpretation

دانلود کتاب Machine learning approaches to bioinformatics

دانلود کتاب Allergy Bioinformatics

دانلود کتاب Systems Metabolic Engineering: Methods and Protocols

دانلود کتاب Introduction to Bioinformatics

دانلود کتاب Statistical Genomics: Methods and Protocols

دانلود کتاب Springer Handbook of Bio-/Neuro-Informatics

دانلود کتاب Bioinformatics Algorithms: Design and Implementation in Python

دانلود کتاب Algebraic and combinatorial computational biology