Bioinformatics for High Throughput Sequencing

توالی یابی نسل بعدی انقلابی در زیست شناسی مولکولی ایجاد کرده است. با توجه به این فناوری جدید، اکنون می توان مجموعه ای از آزمایش ها را با هزینه کم بی سابقه و سرعت بالا انجام داد. اینها از توالی یابی کل ژنوم ها، رونوشت ها و RNA های کوچک غیرکدکننده گرفته تا توصیف مناطق متیله، شناسایی مکان های برهمکنش پروتئین و DNA و تشخیص تنوع ساختاری را شامل می شود. تولید گیگاپایه از اطلاعات توالی برای هر یک از این پهنای باند عظیم از برنامه‌های کاربردی تنها در چند روز، توسعه برنامه‌های بیوانفورماتیک برای تجزیه و تحلیل داده‌های توالی‌یابی نسل بعدی را به همان اندازه چالش برانگیز می‌کند.

Next generation sequencing is revolutionizing molecular biology. Owing to this new technology it is now possible to carry out a panoply of experiments at an unprecedented low cost and high speed. These go from sequencing whole genomes, transcriptomes and small non-coding RNAs to description of methylated regions, identification protein – DNA interaction sites and detection of structural variation. The generation of gigabases of sequence information for each of this huge bandwidth of applications in just a few days makes the development of bioinformatics applications for next generation sequencing data analysis as urgent as challenging.