Antiviral RNAi: Concepts, Methods, and Applications

ویروس‌ها و RNAi در سطوح مختلف رابطه پیچیده‌ای دارند. RNAi یک مکانیسم دفاعی مهم ضد ویروسی در گیاهان و بی مهرگان است، microRNA ها - با منشأ ویروسی یا سلولی - بر بسیاری از جنبه های زیست شناسی ویروس تأثیر می گذارد، و تکثیر بسیاری از ویروس های پستانداران، اگر نه همه، می تواند توسط RNAi سرکوب شود. RNAi ضد ویروسی: مفاهیم، ​​روش ها و کاربردها مجموعه ای از پروتکل ها را برای تجزیه و تحلیل RNA های کوچک ویروسی و پاسخ های RNAi ضد ویروسی طبیعی و همچنین برای توسعه و بهینه سازی داروهای ضد ویروسی مبتنی بر RNAi ارائه می دهد. از آنجایی که RNAi یک مکانیسم تنظیمی مرکزی در سلول است، روش های موجود در این حجم را می توان خارج از زمینه عفونت ویروسی نیز به کار برد. این جلد مفصل که به پنج بخش مناسب تقسیم شده است، مفاهیم اساسی مهم در زمینه RNAi ضد ویروسی را مرور می کند، ابزارهای تجربی و بیو اطلاعاتی را برای تجزیه و تحلیل RNA های خاموش کننده کوچک ارائه می دهد، روش هایی برای تشریح بیوشیمیایی دفاع ضد ویروسی مبتنی بر RNAi و دفاع ضد ویروسی را پوشش می دهد. مکانیسم‌ها، روش‌هایی را برای طراحی، بیان و تحویل siRNA‌های ضد ویروسی درمانی توصیف می‌کند و در نهایت رویکردهای RNAi در سطح ژنوم را برای شناسایی عوامل دخیل در تکثیر ویروس ارائه می‌کند. این فصل‌ها با فرمت بسیار موفق روش‌ها در زیست‌شناسی مولکولی™ نوشته شده‌اند، شامل مقدمه‌ای درباره موضوعات مربوطه، فهرستی از مواد و معرف‌های لازم، پروتکل‌های آزمایشگاهی گام به گام و به آسانی قابل تکرار، و یادداشت‌هایی در مورد عیب یابی و اجتناب از دام های شناخته شده.

معتبر و در دسترس، آنتی ویروس RNAi: مفاهیم، ​​روش ها و کاربردها به عنوان یک راهنمای ایده آل برای تازه کار و با تجربه عمل می کند. محققان به طور یکسان در تلاش برای تشریح نقش RNAi در چرخه حیات ویروسی یا تقویت بیشتر توسعه درمانی جدید و ابزارهای تجربی مبتنی بر فناوری RNAi هستند.

Viruses and RNAi share an intricate relationship at many levels. RNAi is an important antiviral defense mechanism in plants and invertebrates, microRNAs – of viral or cellular origin – affect many aspects of virus biology, and replication of many, if not all, mammalian viruses can be suppressed by RNAi. Antiviral RNAi: Concepts, Methods, and Applications provides a collection of protocols for the analysis of viral small RNAs and natural antiviral RNAi responses as well as for the development and optimization of RNAi-based antiviral drugs. As RNAi is a central regulatory mechanism in the cell, the methods in this volume can also be applied out of the context of a virus infection. Divided into five convenient parts, this detailed volume reviews important basic concepts in the field of antiviral RNAi, provides experimental and bio-informatic tools for the analysis of small silencing RNAs, covers methods to biochemically dissect RNAi-based antiviral defense and viral counter-defense mechanisms, describes methods for the design, expression, and delivery of therapeutic antiviral siRNAs, and finally presents genome-wide RNAi approaches for the identification of factors involved in virus replication. Written in the highly successful Methods in Molecular Biology™ series format, chapters contain introductions to their respective topics, lists of the necessary materials and reagents, step-by-step, readily reproducible laboratory protocols, and notes on troubleshooting and avoiding known pitfalls.

Authoritative and accessible, Antiviral RNAi: Concepts, Methods, and Applications serves as an ideal guide for both novice and experienced researchers alike striving to dissect the role of RNAi in the viral life cycle or to further boost the development of novel therapeutics and experimental tools based on RNAi technology.