Strain Variation in the Mycobacterium tuberculosis Complex: Its Role in Biology, Epidemiology and Control

تا حدود 10 سال پیش، دیدگاه کلی در این زمینه این بود که مایکوباکتریوم توبرکلوزیس، عامل ایجاد کننده سل انسانی یک "کلون" با تنوع توالی طبیعی کافی بین سویه های بالینی به از نظر بیولوژیکی و اپیدمیولوژیکی "مرتبط" در نظر گرفته شود. این دیدگاه در حال حاضر به لطف انقلاب omics، به ویژه ظهور نسل بعدی توالی یابی DNA، کاملاً تغییر کرده است. مطالعات مقایسه ای ژنومی در مقیاس بزرگ در چند سال اخیر نشان داده است که M. سویه های بالینی سلاز نظر ژنتیکی متنوع تر از آنچه قبلاً قدردانی می شد، هستند. علاوه بر این، تعداد فزاینده ای از مطالعات تجربی و اپیدمیولوژیک نشان می دهد که این تنوع ژنتیکی به تنوع فنوتیپی مهم نیز تبدیل می شود. روی هم رفته، این یافته ها به یک تغییر پارادایم منجر شده است، به طوری که در حال حاضر تنوع فیلوژنتیکی در بین M. سل سویه های بالینی در توسعه ابزارهای جدید برای مبارزه با سل مورد توجه قرار گرفته است.
هدف این کتاب گردآوری مجموعه‌ای از مشارکت‌های برخی از تأثیرگذارترین گروه‌هایی است که روی جنبه‌های مختلف M کار می‌کنند. سلتنوع، و که از طریق کار خود به این تغییر پارادایم کمک کرده اند. این شامل نویسندگانی می شود که بر تکامل M تمرکز می کنند. سل در رابطه با سایر اعضای M. مجموعه سل سازگار با حیوانات، تکامل مشترک بین M. سلو انسان، پیامدهای فنوتیپی تنوع سویه ها از دیدگاه تجربی و اپیدمیولوژیک، اکولوژی و تکامل سل مقاوم به دارو، تنوع و تکامل سویه های واکسن BCG، و استفاده از مدل سازی ریاضی برای بررسی تنوع سویه ها و مقاومت دارویی در سل انسانی چنین کتابی تا به حال منتشر نشده است و با توجه به تغییر پارادایم که در بالا توضیح داده شد، این کتاب منبع ارزشمندی هم برای محققان شناخته شده و هم برای دانشمندان جدید، پزشکان و مقامات بهداشت عمومی خواهد بود که به حوزه رو به رشد تحقیقات سل می پیوندند.

Until about 10 years ago, the general view in the field was that Mycobacterium tuberculosis, the causative agent of human tuberculosis was a “clone” with insufficient natural sequence variation between clinical strains to be considered biologically and epidemiologically “relevant”. This view has now changed quite dramatically thanks to the –omics revolution, particularly the advent of next generation DNA sequencing. Large-scale comparative genomic studies over the last few years have revealed that M. tuberculosis clinical strains are more genetically diverse than appreciated previously. Moreover, an increasing number of experimental and epidemiological studies are showing that this genetic diversity also translates into important phenotypic variation. Taken together, these findings have led to a paradigm shift, such that currently phylogenetic diversity among M. tuberculosis clinical strains is being considered in the development of new tools to combat tuberculosis.
The purpose of this book is to bring together a series of contributions from some of the most influential groups working on various aspects of M. tuberculosis diversity, and which through their work have contributed to the this paradigm shift. This includes authors focusing on the evolution of M. tuberculosis in relation to other members of the M. tuberculosis complex adapted to animals, the co-evolution between M. tuberculosis and humans, the phenotypic consequences of strains diversity both from an experimental and epidemiological point of view, the ecology and evolution of drug resistant tuberculosis, the diversity and evolution of the BCG vaccine strains, and the use of mathematical modelling to study strain diversity and drug resistance in human tuberculosis. No such book has ever been published, and given the paradigm shift described above, this book will be a valuable resource both for established researchers as well as new scientists, clinicians and public health officials joining the growing field of tuberculosis research.